2003年,地球上已经有各式各样的机械人,其中大部份机械人都是为人类工作而诞生的,不过,却有小部份机械人不需要人类输入指令,也能随意活动,阿童木便是其中一个拥有「心」的机械人。可惜,这种机械人却被人类反对,因为人类认为它们是危机,原因只有一个--「机械人将会令人类灭亡」。同时间,机械人因为受到人类不同程度的迫害,所以决定向人类反击,而前科学省长官天马博士亦开始制造邪恶机械人。拥有一颗善良「心」、聪明、勇敢、正义而又惹人喜爱的阿童木,为了阻止邪恶机械人对人类进行反击,不惜向邪恶势力挑战,以拯救全人类!
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