故事发生在维斯巴尼亚王国。樱女王的儿子吉尔不幸死于猎枪走火事故。惨剧的消息一传十十传百，轰动了各国新闻界，当然，也传到了江户川柯南和鲁邦三世耳里……
新闻报道称樱女王的长女米拉王女将继承王位成为下届女王，被卷入事件的柯南带着兰来到维斯巴尼亚王国，柯南打算让兰乔装成与他长相极为相似的米拉王女……这个时候，鲁邦向维斯巴尼亚王国下达了“盗窃女王皇冠”的挑战书。于是，柯南和鲁邦各怀心思朝着维斯巴尼亚王国出发了。
鲁邦能否顺利取得皇冠？
皇冠中究竟隐藏着怎样的秘密？
柯南又能否揭露这一连串事件中隐藏的阴谋逮捕真正的犯罪者呢？
“世纪大盗”与“无案不能破的名侦探”因缘际会巅峰对决，鲁邦和柯南的命运究竟会走向何方？
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2月24日，《鲁邦三世VS名侦探柯南》剧创人员在东京都内某地招开了新作即将上映的记者发布会。号称日本动漫界不死传说的“鲁邦三世”和闻名遐迩享誉世界的“名侦探柯南”，终于在21世纪不期而遇，怪盗与侦探的耍宝乱斗即将拉开帷幕。新作作为日本电视台开创55周年纪念将在3月27日晚黄金时段播出。剧创人员在记者招待会上介绍说这部作品的构思始于两年前，通过两部作品制作人和相关工作人员的努力与沟通最终使得作品浮出水面。记者会上工作人员还提到两部作品的声优在合作最初时感到很困惑找不到角色定位，不过看了配音完成之后的作品，声优们都不禁发出感概，“不管怎么说，两部作品融合起来了。”“非常有趣，没有首次合作的感觉呢。”

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